氟化铵对环境会造成负面的影响，能够让水质受到严重的污染。氟化铵是不可燃、有毒，具有强烈的刺激性。氟化铵需要密闭操作，以提供足够的局部通风。防止粉尘排入车间空气中。操作人员必须接受特殊培训，严格遵守操作规程。
建议操作氟化铵的人员戴防尘口罩、胶带、防毒面具和橡胶手套。避免灰尘。避免接触酸和碱。配备泄漏应急处理设备。空容器可能会留下有害物质。
储存氟化铵需要在凉爽、通风的仓库里。远离火和热。让太阳远离太阳。包装密封。与酸、碱、食品化学品分开存放，而不是混合存储。水库应提供适当的防渗材料。
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